Двадцать лет спустя после исчезновения Зиры и Корнелиуса с Планеты Обезьян, на Земле вымерли собаки и кошки. Люди стали заводить обезьян, обучая их выполнять простые домашние обязанности. К 1991 году в Америке сложилась система, где обезьян использовали для труда. В город прибывает Армандо, владелец цирка, с Цезарем – сыном обезьян из будущего, которого считали погибшим. Армандо попадает в поле зрения властей, которые вновь заинтересовались делом Зиры и Корнелиуса. Цезарь, потрясенный жестокостью и несправедливостью, с которыми сталкиваются его сородичи, начинает использовать свой интеллект и дар речи.