В Кремниевом Городе, городе высоких технологий, люди и роботы сосуществуют в мире и согласии. Этот баланс оказывается под угрозой из-за действий неизвестных сил. Защитой города занимается Аки Лайт, обычный школьник-робот. У него есть секрет, скрытый в его программном обеспечении. В случае необходимости, он может активировать протоколы, которые преобразуют его в Мегамена, могущественного героя.