Российская и американская подлодки после столкновения принимают курс на свои базы. Подводники не подозревают, что предстоящий поход станет для них серьёзным испытанием. Российская атомная подлодка «Призрак» захвачена чеченским полевым командиром Кобой. «Призрак» атакует американскую подлодку «Манта» и направляется к берегам США с целью нанесения ядерного удара по Калифорнии. Командир «Манты», Армстронг, объявляет войну таинственной русской субмарине, несмотря на полученные повреждения. Лишь один член экипажа, спецназовец Гаррисон, осознаёт всю опасность врага, ведь у него с Кобой есть личные счеты.