Германия семнадцатого века. Тридцатилетняя война и эпидемия чумы оставили тринадцатилетнего Крабата сиротой. В поисках убежища и пропитания он оказывается у таинственной мельницы, где становится учеником её владельца. Вскоре Крабат понимает, что мельница – это школа чёрной магии. Обучение у Мастера требует высокой платы…