Каждый фильм цикла рассказывает о конкретном регионе России. В проекте представлены Ростовская, Волгоградская, Ульяновская, Челябинская, Свердловская, Ярославская, Тверская, Нижегородская, Астраханская и Калининградская области, Краснодарский край, Республика Карелия, Татарстан, Приэльбрусье и Ямало-Ненецкий автономный округ. Создатели «Таинственной России» изучают местные легенды и мифы. Они стремятся разобраться в их происхождении, отделяя реальные факты от вымысла. В фильмах подробно рассматриваются исторические места, аномальные зоны и необычные природные явления.