Действие происходит в 2047 году. Вторжение инопланетян привело к значительному сокращению населения Земли. Контратаки сил самообороны оказываются недостаточно эффективными. На военной базе в Японии разрабатывается операция под названием «Plan Zet», направленная на спасение человечества и прекращение вторжения. Главный герой, Хироши Акедзима, отправляется на вражескую территорию для участия в этой операции.