В будущем происходит инцидент, связанный с дематериализацией, из-за чего реальность начинает переходить в цифровую форму. Нэтто Хикари и Рокмен прекращают все разработки в киберпространстве и скрываются. Им предстоит найти способ уничтожить программу, пока не наступит критичес��ий мо��ент.