Древнее пророчество предвещает подъем затонувшего города Атлантида. Злая королева Рептилла намерена захватить Атлантиду, как только город появится на поверхности. Чтобы противостоять ей, возрождается гигантская горилла Конг. Его ДНК создана из генетического материала первого Конга и его человеческого брата Джейсона. Конг и его союзники должны предотвратить захват Атлантиды и защитить ее обитателей от Рептиллы.